Создание прототипа, оптимизация работы и тестирование на клинических образцах тест-системы для экспресс-диагностики инфекций центральной нервной системы на основе зондов ДНКзимов

Создание прототипа, оптимизация работы и тестирование на клинических образцах тест-системы для экспресс-диагностики инфекций центральной нервной системы на основе зондов ДНКзимов
Грант ФГБУ "ЦСП" ФМБА РОССИИ
2020
 
Лаборатория гранта: Молекулярная робототехника и биосенсорные материалыМикробиология
 
Абстракт:  Ранняя диагностика инфекционного заболевания – это ключ к его контролируемому течению и адекватно принятым эпидемиологическим мерам. Классические методы детекции, такие как высевы и методы заражения клеточных культур, занимают несколько недель, что недоступно для большинства пациентов. Более современные и распространенные методы молекулярного анализа, такие как полимеразная цепная реакция (ПЦР) или иммуноферментный анализ, требуют меньше времени, помогают более однозначно определить возбудителя, а также, например, определить антибиотикорезистивность у бактерий. Однако, любой современный метод диагностики все еще требует сложной пробоподготовки, специального лабораторного оборудования и квалификации персонала. Уход от этих запросов определяет концепцию приборов диагностики в месте оказания помощи (ДМОП). Такие приборы отличаются мобильностью и минимальными требованиями к квалификации работающего с ними персонала.

Представленный проект направлен на создания прибора ДМОП, использующий метод изотермической ПЦР для накопления вещества и детекцию с помощью ДНК-наносенсоров  для узнавания фрагмента и визуализации результата.

Задачами данного проекта является отработка данной системы амплификации и детекции в прототипе настольной биолаборатории и тестирование разработанного прибора в условиях клинической лаборатории на клинических образцах.

 
Результаты: В результате выполнения проекта был создан прототип устройства, способный проводить анализ наличия 16 патогенов центральной нервной системы в образцах спинномозговой жидкости. Чувствительность системы составила как минимум 1000 геномных эквивалентов в мультиплексном формате и как минимум 100 геномных эквивалентов в синглплексном формате. Устройство автоматическое, закрытого типа и достаточно компактно, чтобы отвечать отвечать требованиям приборов для анализа в месте оказания помощи