"Разработка ДНК-кассеты на основе бинарного дезоксирибозима для снижения фонового сигнала при детекции аналитов"
Грант РНФ
2021-2023

Детекция фрагментов нуклеиновых кислот с помощью ДНК-машин на основе бинарных ДНКзимов в перспективе может стать хорошей альтернативой таким методам как ПЦР в реальном времени ввиду того, что ДНК-машины потенциально могут быть менее трудоёмкой и дорогостоящей технологией, но при этом не менее точной и селективной. ДНК-машины работают таким образом, что при детекции нужного фрагмента ДНК или РНК формируется ядро ДНКзима, обладающее каталитической активностью, которое расщепляет флуоресцентный субстрат, на выходе давая флуоресцентный сигнал. На данный момент ДНК-машины показали свою эффективность в детекции аналитов после амплификации, но на данный момент все еще предстоит оптимизировать систему так, чтобы добиться настолько высокой точности, чтобы можно было обойтись без амплификации вовсе. Данный проект направлен на создание конструкции под названием «ДНК-кассета», которая устроена так, чтобы снизить фоновый сигнал от флуоресцентных субстратов до минимума и локализовать составные части этой системы так, чтобы повысить чувствительность системы на несколько порядков. Избавление от необходимости амплификации фрагментов нуклеиновых кислот при таком виде детекции поможет сделать генетическую диагностику и диагностику инфекционных заболеваний намного проще и доступнее.