Геномы и генетическое разнообразие куньих (сем. Mustelidae) России и Юго-Восточной Азии

 

Абстракт: Цель проекта изучить генетическое разнообразие представителей семейства куньих (рода Martes и Mustela) России и Юго Восточной Азии. Для соболя (и по возможности для других видов) получить полногеномные данные для различных популяций России. Сделать оценку генетического разнообразия и провести филогеографический анализ современных популяций соболя на полногеномном уровне. Провести аннотацию, анализ и сравнение как полученных при выполнении Проекта, так и ранее опубликованных геномов куньих, в первую очередь для представителей родов Martes и Mustela. Сделать репрезентативную STR-панель соболя для ДНК-фингерпринтинг.

 

Планируемый результат: 

1. Получение аннотированных референсных сборок генома хромосомного уровня для как минимум шести видов куньих изродов Martes и Mustela.

2. Получение сравнительных хромосомных карт изучаемых видов, установление связи полученных геномных данных с кариотипами и опубликованными ранее цитогенетическими данными.

3. Разрешение вопросов принадлежности Martes flavigula и Mustela strigidorsa к их текущим родам и проверку состоятельности харзы как единого вида.

4. Анализ генетического разнообразия и смешения (admixture) в современных популяциях соболя.

5. Разработка STR-панели для соболя.